Els professors del Departament d'Economia pertanyen a quatre grups de recerca de la Universitat Rovira i Virgili: Anàlisi Econòmica i Salut (GRAES), Indústria i Territori (GRIT), Organització i Decisió Econòmiques (GRODE) i Economia Quantitativa, Urbana i Regional (QURE). Tots ells estan reconeguts com a grups consolidats per la Generalitat de Catalunya, i els seus membres han aconseguit en convocatòries públiques nombrosos projectes d'investigació.
Amb la finalitat de promoure la recerca transversal, l'any 2010 es va crear el Centre de Recerca en Economia Industrial i Economia Pública (CREIP), que integra la majoria dels investigadors del Departament d'Economia. El 2020 es va crear el Centre de Recerca en Economia i Sostenibilitat (ECO-SOS), que neix del seu antecessor CREIP, a partir d'uns canvis d'orientació en les línies de recerca. Els Grups de recerca, l'ECO-SOS i el Departament mateix organitzen de manera conjunta un Seminari setmanal, i fomenten el debat científic a través de la publicació d'una sèrie de Documents de Treball.